O campus universitário da UNIFENAS, em Belo Horizonte, foi inaugurado em 2003. A Universidade iniciou suas atividades nesta capital em 2001, primeiramente com o curso de Administração.
As duas unidades (Líbano e Boaventura) estão localizadas na região da Pampulha e possuem instalações modernas e adequadas para dar suporte ao ensino, à pesquisa e à extensão. Os docentes são qualificados e titulados em programas de mestrado, doutorado e pós-doutorado.
Na unidade Líbano funciona também o Centro de Ensino e Atenção à Saúde da Comunidade (CEASC), voltado para o atendimento clínico a pacientes em nível de Atenção Secundária à Saúde (especialidades médicas), que amplia e diversifica os ambientes de ensino-aprendizagem dos acadêmicos.